Mecanismo de Interacción entre la (3s)-3-Amino-1- Hidroxi-3,4-Dihidroquinolin-2-(1h)-Ona y la Quinurenina Aminotransferasa I (Kat I), por Mecánica Molecular
Resumen
En la presente investigación, se ha querido estudiar fenómenos relacionados a la en- fermedad de la esquizofrenia, la cual afecta y afectará a un buen número de personas. Es así que se analizó la interacción de la KAT I unida a su cofactor PLP, y un fárma- co modelo. Hemos obtenido las estructuras disponibles en la literatura para la KAT I, mediante un proceso de completado de la estructura secundaria desde su infor- mación de la estructura primaria de los restos aminoacídicos del sistema. Se obtuvo las estructuras en el equilibrio del fármaco (3S)-amino-1-hidroxi-3,4-dihidroquinolin-
2(1H)-ona y la enzima KAT I (unida al cofactor), así como el sistema acoplado. Se analizó el RMSD, RMSF, Diagrama de Ramachandran, y en algún caso la naturaleza de los puentes de hidrógeno, y la conservación de la estructura secundaria durante el proceso de la dinámica molecular en toda la trayectoria. El proceso de acoplamiento fue identificado mediante un acoplamiento Docking, para su posterior estabilización mediante una simulación de dinámica molecular del mismo, logrando determinar un mínimo en la hipersuperficie de potencial para el sistema interactuante de la enzi- ma KAT I (unida a su cofactor), el cual se adhiere al fármaco (3S)-amino-1-hidroxi-
3,4-dihidroquinolin-2(1H)-ona, lo que sugiere un proceso de inhibición.
Palabras clave: Esquizofrenia, bioinformática.